MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis str. Erdman = ATCC 35801 DNA

Total Repeats: 98767

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020559	CAC	2	6	27	32	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	471335785
2	NC_020559	GTC	2	6	46	51	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471335785
3	NC_020559	GAC	2	6	79	84	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471335785
4	NC_020559	CAG	2	6	90	95	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471335785
5	NC_020559	TCG	2	6	167	172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471335785
6	NC_020559	AGC	2	6	199	204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471335785
7	NC_020559	GCC	2	6	260	265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471335785
8	NC_020559	CCG	2	6	304	309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471335785
9	NC_020559	CGAC	2	8	311	318	25 %	0 %	25 %	50 %	471335785
10	NC_020559	CGA	2	6	324	329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471335785
11	NC_020559	GCC	2	6	339	344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471335785
12	NC_020559	ACG	2	6	389	394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471335785
13	NC_020559	TGA	2	6	399	404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471335785
14	NC_020559	CGTT	2	8	527	534	0 %	50 %	25 %	25 %	471335785
15	NC_020559	CGC	3	9	561	569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471335785
16	NC_020559	CCCG	2	8	589	596	0 %	0 %	25 %	75 %	471335785
17	NC_020559	AC	3	6	643	648	50 %	0 %	0 %	50 %	471335785
18	NC_020559	GGCA	2	8	660	667	25 %	0 %	50 %	25 %	471335785
19	NC_020559	GTT	2	6	681	686	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	471335785
20	NC_020559	CGA	2	6	810	815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471335785
21	NC_020559	TTC	2	6	856	861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471335785
22	NC_020559	CAA	2	6	888	893	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	471335785
23	NC_020559	TCATC	2	10	902	911	20 %	40 %	0 %	40 %	471335785
24	NC_020559	CCCA	2	8	918	925	25 %	0 %	0 %	75 %	471335785
25	NC_020559	AGC	2	6	926	931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471335785
26	NC_020559	ACC	2	6	993	998	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	471335785
27	NC_020559	CGA	2	6	1062	1067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471335785
28	NC_020559	CAG	2	6	1086	1091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471335785
29	NC_020559	GC	3	6	1121	1126	0 %	0 %	50 %	50 %	471335785
30	NC_020559	GCG	2	6	1237	1242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471335785
31	NC_020559	CCG	2	6	1259	1264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471335785
32	NC_020559	CA	3	6	1408	1413	50 %	0 %	0 %	50 %	471335785
33	NC_020559	CAC	2	6	1491	1496	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	471335785
34	NC_020559	CGTTT	2	10	2092	2101	0 %	60 %	20 %	20 %	471335786
35	NC_020559	GTGG	2	8	2132	2139	0 %	25 %	75 %	0 %	471335786
36	NC_020559	GCCA	2	8	2150	2157	25 %	0 %	25 %	50 %	471335786
37	NC_020559	CGGTGC	2	12	2164	2175	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	471335786
38	NC_020559	GTT	2	6	2186	2191	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	471335786
39	NC_020559	CCG	2	6	2242	2247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471335786
40	NC_020559	TTG	2	6	2304	2309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	471335786
41	NC_020559	CGA	2	6	2407	2412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471335786
42	NC_020559	TTG	2	6	2463	2468	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	471335786
43	NC_020559	ATT	2	6	2477	2482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	471335786
44	NC_020559	TCAG	2	8	2494	2501	25 %	25 %	25 %	25 %	471335786
45	NC_020559	CGC	2	6	2510	2515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471335786
46	NC_020559	GAC	2	6	2523	2528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471335786
47	NC_020559	GGT	2	6	2576	2581	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471335786
48	NC_020559	CGT	2	6	2635	2640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471335786
49	NC_020559	GCC	2	6	2691	2696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471335786
50	NC_020559	CGG	2	6	2708	2713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471335786
51	NC_020559	CGTT	2	8	2720	2727	0 %	50 %	25 %	25 %	471335786
52	NC_020559	GCA	2	6	2794	2799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471335786
53	NC_020559	CTT	2	6	2808	2813	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471335786
54	NC_020559	AC	3	6	2855	2860	50 %	0 %	0 %	50 %	471335786
55	NC_020559	CCA	2	6	2869	2874	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	471335786
56	NC_020559	GC	3	6	2932	2937	0 %	0 %	50 %	50 %	471335786
57	NC_020559	GAT	2	6	2988	2993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471335786
58	NC_020559	TTG	3	9	3016	3024	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	471335786
59	NC_020559	ACGG	2	8	3072	3079	25 %	0 %	50 %	25 %	471335786
60	NC_020559	GCCT	2	8	3134	3141	0 %	25 %	25 %	50 %	471335786
61	NC_020559	CGG	2	6	3205	3210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471335786
62	NC_020559	CGGTT	2	10	3241	3250	0 %	40 %	40 %	20 %	471335786
63	NC_020559	CGTC	2	8	3285	3292	0 %	25 %	25 %	50 %	471335787
64	NC_020559	TTG	2	6	3362	3367	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	471335787
65	NC_020559	CGA	2	6	3416	3421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471335787
66	NC_020559	GGTA	2	8	3465	3472	25 %	25 %	50 %	0 %	471335787
67	NC_020559	GTG	2	6	3499	3504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471335787
68	NC_020559	ACG	2	6	3506	3511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471335787
69	NC_020559	CAA	2	6	3555	3560	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	471335787
70	NC_020559	ATC	2	6	3576	3581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471335787
71	NC_020559	TGT	2	6	3623	3628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	471335787
72	NC_020559	GGTT	2	8	3647	3654	0 %	50 %	50 %	0 %	471335787
73	NC_020559	CGG	2	6	3673	3678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471335787
74	NC_020559	GAT	2	6	3688	3693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471335787
75	NC_020559	GT	3	6	3812	3817	0 %	50 %	50 %	0 %	471335787
76	NC_020559	TGG	2	6	3869	3874	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471335787
77	NC_020559	CCGC	2	8	3875	3882	0 %	0 %	25 %	75 %	471335787
78	NC_020559	GAA	2	6	3915	3920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471335787
79	NC_020559	AGC	2	6	4029	4034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471335787
80	NC_020559	GGC	2	6	4044	4049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471335787
81	NC_020559	GGC	2	6	4053	4058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471335787
82	NC_020559	GAC	2	6	4111	4116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471335787
83	NC_020559	GGC	2	6	4200	4205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471335787
84	NC_020559	TGG	2	6	4227	4232	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471335787
85	NC_020559	GTT	2	6	4242	4247	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	471335787
86	NC_020559	CGA	2	6	4251	4256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471335787
87	NC_020559	CGG	2	6	4301	4306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471335787
88	NC_020559	CCG	2	6	4313	4318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471335787
89	NC_020559	CCG	2	6	4358	4363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471335787
90	NC_020559	GGT	2	6	4422	4427	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471335787
91	NC_020559	TGC	3	9	4532	4540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471335788
92	NC_020559	CG	5	10	4542	4551	0 %	0 %	50 %	50 %	471335788
93	NC_020559	GTCGG	2	10	4589	4598	0 %	20 %	60 %	20 %	471335788
94	NC_020559	CGA	2	6	4611	4616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471335788
95	NC_020559	GGT	2	6	4745	4750	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471335788
96	NC_020559	CCA	2	6	4754	4759	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	471335788
97	NC_020559	ACG	2	6	4792	4797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471335788
98	NC_020559	CGC	2	6	4877	4882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471335788
99	NC_020559	CGG	2	6	4927	4932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471335788
100	NC_020559	CG	3	6	4978	4983	0 %	0 %	50 %	50 %	471335788
101	NC_020559	GTG	2	6	5174	5179	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471335789
102	NC_020559	GCG	2	6	5191	5196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471335789
103	NC_020559	GAG	2	6	5222	5227	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	471335789
104	NC_020559	AAG	2	6	5255	5260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471335789
105	NC_020559	GGT	2	6	5383	5388	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471335789
106	NC_020559	CGA	2	6	5401	5406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471335789
107	NC_020559	TGC	2	6	5442	5447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471335789
108	NC_020559	CGA	2	6	5473	5478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471335789
109	NC_020559	CCAC	2	8	5499	5506	25 %	0 %	0 %	75 %	471335789
110	NC_020559	ACCG	2	8	5518	5525	25 %	0 %	25 %	50 %	471335789
111	NC_020559	GTG	2	6	5531	5536	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471335789
112	NC_020559	CGG	2	6	5554	5559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471335789
113	NC_020559	TGG	2	6	5590	5595	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471335789
114	NC_020559	CGGCGT	2	12	5602	5613	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	471335789
115	NC_020559	GGT	2	6	5617	5622	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471335789
116	NC_020559	CAAG	2	8	5713	5720	50 %	0 %	25 %	25 %	471335789
117	NC_020559	AAG	2	6	5732	5737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471335789
118	NC_020559	CGCC	2	8	5809	5816	0 %	0 %	25 %	75 %	471335789
119	NC_020559	CAA	2	6	5839	5844	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	471335789
120	NC_020559	CGA	2	6	5866	5871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471335789
121	NC_020559	GTC	2	6	5891	5896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471335789
122	NC_020559	TGG	2	6	6009	6014	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471335789
123	NC_020559	AGC	2	6	6056	6061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471335789
124	NC_020559	GGC	2	6	6176	6181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471335789
125	NC_020559	GC	3	6	6204	6209	0 %	0 %	50 %	50 %	471335789
126	NC_020559	GGT	2	6	6217	6222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471335789
127	NC_020559	AAGGAC	2	12	6254	6265	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	471335789
128	NC_020559	AGACCA	2	12	6348	6359	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	471335789
129	NC_020559	GCG	2	6	6520	6525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471335789
130	NC_020559	CGGC	2	8	6624	6631	0 %	0 %	50 %	50 %	471335789
131	NC_020559	ATC	2	6	6692	6697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471335789
132	NC_020559	GC	3	6	6710	6715	0 %	0 %	50 %	50 %	471335789
133	NC_020559	ATC	2	6	6752	6757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471335789
134	NC_020559	ACG	2	6	6780	6785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471335789
135	NC_020559	TGT	2	6	6867	6872	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	471335789
136	NC_020559	GTT	3	9	6877	6885	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	471335789
137	NC_020559	CCG	2	6	6935	6940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471335789
138	NC_020559	CTG	2	6	7007	7012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471335789
139	NC_020559	GAA	2	6	7033	7038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471335789
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148	NC_020559	GCC	2	6	7319	7324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471335790
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155	NC_020559	ACC	2	6	7552	7557	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	471335790
156	NC_020559	TGG	2	6	7627	7632	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471335790
157	NC_020559	CGG	2	6	7672	7677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471335790
158	NC_020559	CGA	2	6	7736	7741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471335790
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163	NC_020559	ACG	2	6	7924	7929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471335790
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242	NC_020559	GCC	2	6	11977	11982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471335794
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244	NC_020559	TGC	2	6	12014	12019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471335794
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246	NC_020559	GAGC	2	8	12092	12099	25 %	0 %	50 %	25 %	471335794
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248	NC_020559	CGG	2	6	12148	12153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471335794
249	NC_020559	GAG	2	6	12210	12215	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	471335794
250	NC_020559	CTCA	2	8	12303	12310	25 %	25 %	0 %	50 %	471335794
251	NC_020559	ACG	2	6	12664	12669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471335795
252	NC_020559	CGG	2	6	12737	12742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471335795
253	NC_020559	CGA	2	6	12761	12766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471335795
254	NC_020559	TCA	2	6	12850	12855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471335795
255	NC_020559	GGT	2	6	12986	12991	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471335795
256	NC_020559	TCG	2	6	13034	13039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471335796
257	NC_020559	CAG	2	6	13223	13228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471335797
258	NC_020559	C	6	6	13229	13234	0 %	0 %	0 %	100 %	471335797
259	NC_020559	GGC	2	6	13267	13272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471335797
260	NC_020559	TCG	2	6	13287	13292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471335797
261	NC_020559	GAT	2	6	13298	13303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471335797
262	NC_020559	AACC	2	8	13338	13345	50 %	0 %	0 %	50 %	471335797
263	NC_020559	GC	3	6	13389	13394	0 %	0 %	50 %	50 %	471335797
264	NC_020559	CCCG	2	8	13447	13454	0 %	0 %	25 %	75 %	471335797
265	NC_020559	CAA	2	6	13735	13740	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	471335798
266	NC_020559	AAC	2	6	13886	13891	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	471335798
267	NC_020559	ACCTTC	2	12	13919	13930	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	471335798
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270	NC_020559	GGCGT	2	10	14154	14163	0 %	20 %	60 %	20 %	471335799
271	NC_020559	TGCT	2	8	14182	14189	0 %	50 %	25 %	25 %	471335799
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280	NC_020559	GGGCC	2	10	14437	14446	0 %	0 %	60 %	40 %	471335799
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282	NC_020559	CG	3	6	14495	14500	0 %	0 %	50 %	50 %	471335799
283	NC_020559	CAT	2	6	14604	14609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471335799
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288	NC_020559	GCT	2	6	14716	14721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471335799
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290	NC_020559	ACT	2	6	14870	14875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471335799
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292	NC_020559	ACC	2	6	15014	15019	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	471335800
293	NC_020559	GCC	2	6	15034	15039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471335800
294	NC_020559	GC	3	6	15093	15098	0 %	0 %	50 %	50 %	471335800
295	NC_020559	GCA	2	6	15133	15138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471335800
296	NC_020559	CA	3	6	15137	15142	50 %	0 %	0 %	50 %	471335800
297	NC_020559	GCGTT	2	10	15182	15191	0 %	40 %	40 %	20 %	471335800
298	NC_020559	CAG	2	6	15237	15242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471335800
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362	NC_020559	CTGG	2	8	17908	17915	0 %	25 %	50 %	25 %	471335802
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371	NC_020559	GCCG	2	8	18426	18433	0 %	0 %	50 %	50 %	471335802
372	NC_020559	GGT	2	6	18568	18573	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471335802
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381	NC_020559	CG	3	6	19065	19070	0 %	0 %	50 %	50 %	471335803
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385	NC_020559	GCC	2	6	19155	19160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471335803
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387	NC_020559	CG	4	8	19323	19330	0 %	0 %	50 %	50 %	471335803
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499	NC_020559	GCC	2	6	24161	24166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471335807
500	NC_020559	GCTG	2	8	24195	24202	0 %	25 %	50 %	25 %	471335807

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